Aplikacje/ Zastosowanie

platformy NGS firmy Illumina: MiSeq i HiSeq.

Pracownia oferuje kompleksowe usługi sekwencjonowania genomowego w technologii NGS, począwszy od izolacji materiału (z tkanek, osadu leukocytarnego, krwi, wymazu), przez oczyszczanie, oznaczanie ilościowe metodą fluorymetryczną (Qubit), przygotowanie bibliotek, po sekwencjonowanie i analizę bioinformatyczną. 

• Analiza genomu

- Sekwencjonowanie całogenomowe,
- Sekwencjonowanie de novo,
- Sekwencjonowanie de novo małych genomów (bakterie, drożdże, wirusy) lub plazmidów
- Sekwencjonowanie typu Mate Pair,
- Sekwencjonowanie exomów,
- Resekwencjonowanie celowane,
- Sekwencjonowanie amplikonów,
 

• Analiza transkryptomu

- Sekwencjonowanie RNA - RNAseq,

- Sekwencjonowanie miRNA

• Analiza epigenomu

- Analiza interakcji DNA-białko (Chip-Seq)
- Analiza metylacji

• Dodatkowo

- Mikromacierze ekspresyjne

- Metagenomika (16S)

- Panele genetyczne:

• Panelenowotworowe
  • mutacje germinalne (predyspozycje genetyczne) - całe spektrum nowotworów lub poszczególne panele nowotworowe:
    • rak jelita grubego
    • rak piersi
    • rak prostaty
    • rak płuc
    • rak trzustki
    • rak tarczycy
    • rak żołądka
  • mutacje somatyczne
• Kardiomiopatie
• Autyzm
• Całe spektrum wrodzonych chorób genetycznych

Cennik

Ceny sekwencjonowania z wykorzystaniem sekwenatoraMiSeq:
350 - 500 PLN netto za przygotowanie biblioteki z jednej próbki
9 000 - 12 000 PLN netto za sekwencjonowanie. 

W zależności od liczby prób, kompleksowości eksperymentu cennik może ulec zmianie.

Wycena sekwencjonowania na platformie HiSeq dokonywana jest w zależności od rodzaju projektu.

Usługa krok po kroku:

1 - pomoc w zaprojektowaniu eksperymentu

2 - przygotowanie bibliotek

3 - sekwencjonowanie bibiotek na sekwenatorze NGS - MiSeq lub HiSeq

4 - analiza bioinformatyczna