• /
• Kalendarium /
• Wprowadzenie do obróbki i analizy danych NGS

Wprowadzenie do obróbki i analizy danych NGS

Data rozpoczęcia	2017-06-23
Data zakończenia	2017-06-23
Organizator	ideas4biology Sp. z o.o.
Miejsce	Wydział Biologii UAM w Poznaniu
Branże	Farmacja, Biotechnologia, Kosmetologia
Email rekrutacji	office@ideas4biology.com
Dodaj do kalendarza

Kurs odbędzie się 23 czerwca 2017 r. na Wydziale Biologii UAM w Poznaniu (ul. Umultowska 89).

Przeznaczony dla wszystkich osób, które chcą zapoznać się z podstawowymi zagadnieniami związanymi z sekwencjonowaniem nowej generacji. Niezależnie od tego, czy planują Państwo analizować dane samodzielnie, czy współpracować ze specjalistami w tej dziedzinie, na pewno warto wzbogacić swoją wiedzę o tego typu zagadnienia. Od uczestników kursu nie jest wymagana umiejętność programowania.

Oto zagadnienia, które zostaną poruszone podczas kursu:
 

• Wyniki sekwencjonowania w technologii NGS

W jaki sposób dane powstają, są przechowywane, obrabiane i zastosowane w przykładowych projektach badawczych. Poznamy bazy danych i formaty plików oraz przeprowadzimy kontrolę jakości danych NGS (FastQC, FASTX Toolkit, Trimmomatic).
 

• Mapowanie

Mapowanie krótkich odczytów pochodzących z technologii DNA–Seq (Bowtie, BWA) oraz RNA–Seq (Tophat, STAR). Poznamy rózne strategie i metody, ich wady i zalety.

Dla kogo przeznaczony jest ten kurs?
Kurs skierowany jest dla wszystkich osób związanych z biologią, biotechnologią, bioinformatyką (ale nie tylko), które chcą się nauczyć jak przeprowadzić kontrolę jakości danych pochodzących z sekwencjonowania nowej generacji oraz jak mapować odczyty do genomu bądź transkryptomu i przeprowadzać operacje na wynikach mapowania.

Czy sobie poradzisz? Na pewno!
Kurs przygotowany jest tak, aby każdy, nawet najbardziej początkujący uczestnik, mógł sobie bez problemu poradzić z wykonaniem wszystkich zadań. Nie jest wymagana umiejętność programowania.