Portal Labnews.pl korzysta z Javascript. Włącz go w swojej przeglądarce, aby w pełni cieszyć się portalem. Nie wiesz jak? Kliknij tutaj.

Annotacja genomów i proteomów u eukariota

Data rozpoczęcia	2015-03-06
Data zakończenia	2015-03-07
Organizator	MBS - Szkolenia, Konferencje, Usługi Sp. z o.o.
Miejsce	Warszawa
Branże	Farmacja, Biotechnologia
Email rekrutacji	mbs@mbs.biz.pl
Dodaj do kalendarza

Sekwencjonowanie genomu jest dopiero początkiem zrozumienia podstaw funkcjonowania organizmu na poziomie molekularnym. Kolejnym etapem w rozszyfrowywaniu genomu jest odnalezienie w nim sekwencji kodujących białka oraz RNA nie kodujących białek (miRNA, ncRNA, lcnRNA i inne) a następnie przewidzenie ich funkcji w organizmie. Transkrypcja genów jest regulowana przez wiele czynników, część z nich można zidentyfikować stosując analizę sekwencji DNA in silico. Funkcja genów jest często ewolucyjnie konserwatywna. Porównanie annotacji ortologicznych genów u różnych organizmów jest dobrym podejściem do przewidzenia funkcji genu. Można to zrobić poprzez porównanie sekwencji DNA i/lub białek lub metodami ab initio poprzez wyszukiwanie charakterystycznych elementów strukturalnych i sygnałów molekularnych.

I dzień
09:00 – 09:10	Otwarcie szkolenia
09:10 – 10:30	Annotacja sekwencji DNA - wykład
10:30 – 11:30	Programy do annotacji sekwencji DNA - wykład
11:30 – 11:45	Przerwa
11:45 – 12:45	Annotacja sekwencji DNA eukariota, znajdowanie sekwencji kodujących (programy AUGUSTUS, GeneID, GBF) - ćwiczenie
12:45 – 13:45	Identyfikacja genów, których ekspresja może być regulowana przez miRNA (ComiR, miRmap) - ćwiczenie
13:45 – 14:15	Przerwa
14:15 – 15:15	Znajdowanie promotorów RNA polimerazy II i III typu, wysp CpG, miejsc poliadenylacji - ćwiczenie
15:15 – 16:15	Annotacja sekwencji białek - wykład
II dzień
09:00 – 10:30	Transkrypcja, regulacyjne rejony genów i ich struktura - wykład
10:30 – 11:30	Programy i metody bioinformatycznej analizy transkrypcji - wykład
11:30 – 11:45	Przerwa
11:45 – 13:00	Identyfikacja miejsc wiązania czynników transkrypcyjnych w promotorach - ćwiczenie
13:00 – 15:00	Annotacja sekwencji białek - ćwiczenie
15:00	Zakończenie szkolenia

Prowadzący: Dr hab. Tadeusz Malewski

Termin: 6 – 7 marca 2015 roku

Miejsce: BIT Polska, ul. Ostrobramska 101A, Warszawa

Karty Zgłoszenia oraz opłaty należy przesyłać do dnia 27 lutego 2015 r.

Ponieważ ilość miejsc jest ograniczona organizatorzy zastrzegają sobie prawo do wcześniejszego zamknięcia listy w przypadku wyczerpania wolnych miejsc.

Dodatkowych informacji udziela:

Dr Arleta Malewska: mbs@mbs.biz.pl, Tel (22) 401 10 38; 607 929 471

Opłata za udział w kursie wynosi 1420 zł brutto.

Opłata obejmuje: