• /
• Kalendarium /
• Wprowadzenie do analizy danych RNA-Seq

Wprowadzenie do analizy danych RNA-Seq

Data rozpoczęcia	2017-06-10
Data zakończenia	2017-06-11
Organizator	ideas4biology Sp. z o.o.
Miejsce	Wydział Biologii UAM w Poznaniu
Branże	Farmacja, Biotechnologia, Kosmetologia
Email rekrutacji	office@ideas4biology.com
Dodaj do kalendarza

Kurs odbędzie się w dniach 10-11 czerwca 2017 r. na Wydziale Biologii Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu (ul. Umultowska 89).

Zachęcamy do rejestrowania się. Koszt uczestnictwa wynosi 700 zł.

Jakie zagadnienia zostaną omówione i przećwiczone?

• Krótkie wprowadzenie do NGS i RNA-Seq.
• Kontrola jakości danych.
• Mapowanie odczytów, szacowanie ekspresji genów i transkryptów.
• Analiza ekspresji różnicowej, wizualizacja wyników.
• Składanie transkryptów de novo.
• Składanie transkryptów ab initio.
• Analiza małych RNA, w tym identyfikacja mikroRNA.

Dla kogo przeznaczony jest ten kurs?
Kurs skierowany jest dla wszystkich osób związanych z biologią, biotechnologią, bioinformatyką (ale nie tylko), które chcą się nauczyć jak analizować wielkoskalowe dane pochodzące z sekwencjonowania transkryptomów (RNA-seq).

Jakie będą efekty?
Po ukończeniu kursu, uczestnik powinien wiedzieć jakie źródła i formaty danych najczęściej spotykamy, jak skontrolować jakość odczytów, zmapować je do genomu lub transkryptomu.
Dodatkowo będzie również potrafił oszacować ekspresję genów i transkryptów oraz przeprowadzić analizę ekspresji różnicowej. Uczestnicy nauczą się jak podejść do składania transkryptomów i analiz małych regulatorowych RNA. Ważnym elementem będzie też tworzenie i interpretowanie wykresów ułatwiających analizę danych.

Czy sobie poradzisz? Na pewno!
Kurs przygotowany jest tak, aby każdy, nawet najbardziej początkujący uczestnik, mógł sobie bez problemu poradzić z wykonaniem wszystkich zadań. Nie jest wymagana umiejętność programowania.
Wskazana znajomość podstawowych zagadnień z biologii molekularnej i sekwencjonowania.